2019進入了尾聲,在此分享2019年度的文獻回顧,並簡單整理電子書中的研究主題,提供給各位醫學相關人士參考。

Mass SNP cover Design.jpg

一、ERCC5、ERCC1、MSH2和MLH1的基因多型性,與接受合併化學及放射線治療(Concurrent Chemoradiotherapy , CCRT)的男性口腔鱗狀細胞癌患者術後存活率有關

    核苷酸切除修復(NER)的運作機制,在修復DNA的工作中扮演十分重要的角色。他們調查了NER途徑中,重要的SNP以及鱗狀細胞癌(OSCC)患者的口服同步放化療(CCRT)臨床療效之間的關聯。文中使用了iPLEX MassARRAY技術,為319名男性OSCC患者進行 5個關鍵NER基因中的13個SNP基因分型。利用Cox比例風險模型和Kaplan–Meier生存曲線來估計死亡或複發的風險。 研究發現,XPC基因的 rs2228000 位點為TT分型時,生存率較差。 ERCC5基因的 rs17655和ERCC1的rs735482若為CC型別,則可能與無病存活率(disease-free survival, DFS)的惡化相關;此外,也更容易復發。本篇研究顯示 ERCC5基因 rs17655 位點的CC分型和ERCC1基因 rs735482位點的 CC分型會增加OSCC男性患者進行CCRT治療復發的風險。因此,針對這類基因型的攜帶者,CCRT的治療對於患者的幫助有限,應該考慮施行其他替代療法。

    而MSH2基因的 rs3732183位點為GG基因型則表現出較低的複發風險。 此外,MLH1基因的 rs1800734位點若為 GG基因型,則會表現出更高的存活率和無病存活率。因此,MSH2 rs3732183和MLH1 rs1800734的基因型與
使用輔助CCRT治療的OSCC患者生存率相對較高,這些基因多型性分析結果可以作為OSCC患者的預後指標。


二、利用一種簡單且高度專一性的DNA測定法,來驗證免疫化學測試陽性的糞便檢體

    有75%的人在糞便免疫化學測試(FIT)陽性中為假陽性,而進行了不必要的大腸鏡檢查。這篇文章中,他們利用MassARRAY技術,建立了一個單一等位基因鹼基延伸反應(SABER)的糞便DNA(sDNA)篩檢,可提高FIT檢測結直腸癌(CRC) 的準確性。他們在5個CRC相關基因中選擇了21個突變,用於檢測糞便檢體DNA。
    首先,他們進行準確性評估測試,分析了細胞株DNA和從34名患者採集成套的已知突變組織(數據1)。並在臨床101個獨立FIT陽性糞便樣本中,進一步評估了sDNA分析的性能(數據2)。在數據1中,他們獲得了62%的突變CRC組配對的組織和糞便樣本中的一致性率。在第2組中,FIT結果陽性的正常對照組具有100%的特異性。
    透過加權FIT數值及糞便的突變基因型,並將兩個分數相加,研究人員發現分數每增加1倍,FIT陽性患者的惡化風險就增加4.538倍(95%CI = 2.121–9.309)。這種新的sDNA分析可以幫助臨床單位找出FIT陽性患者的高危險群,列出優先順序,迅速接受結腸鏡檢查以確認是否罹患大腸直腸癌。

 

三、比較兩種檢測 : 肺腺癌患者的血漿循環腫瘤DNA之EGFR突變的方法

    EGFR突變與多種腫瘤有關。這篇研究旨在比較兩種方法檢測肺腺癌(LUAD)患者中的ctDNA EGFR突變,並進行評估ctDNA中EGFR突變的臨床意義。在這個研究中,首先檢測了77例IIIB或IV 期LUAD患者的肺癌組織EGFR突變狀態。比較ARMS檢測系統和單一等位基因鹼基延伸反應 (SABER / MassARRAY)這兩種方法,然後對一線EGFR-TKI治療和生存率進行了評估。ARMS檢測血漿ctDNA EGFR突變的整體靈敏度和專一性分別為49.1%,56%;SABER / MassARRAY方法分別為90%和95%。這些方法之間結果的一致性很高。此外,有43名攜帶EGFR突變的患者還接受了一線EGFR-TKI治療。值得注意的是,血漿ctDNA帶有EGFR突變的患者與未檢測到EGFR突變的患者相比, 其疾病無惡化存活期(progression-free survival)及總體生存率(OS) 較短。血漿ctDNA中EGFR突變的檢測具有極少的侵入性,對於一線EGFR-TKI治療後預後不良的患者而言,是一個可靠的突變檢測替代方法。

 

四、結合"微衛星序列不穩定性" (Microsatellite Instability) 和"高微衛星序列在特定的四核苷酸重複序列變異"(Elevated Microsatellite Alterations at Selected Tetranucleotide Repeats,EMAST)----這兩種檢測方法是更有前景的大腸癌免疫生物標誌物

    有一型的微衛星序列不穩定性(MSI)會影響四核苷酸重複序列,被稱為EMAST,這種變異目前發現是多種癌症的潛在生物標誌物。文中研究人員評估了1,505例CRC患者的5種EMAST標記和1項MSI標記檢測套組。並利用MassArray鑑定常見的大腸直腸癌突變,以NGS分析DNA修復基因。研究發現EMAST陽性和MSI高(MSI-H)的人群中,分別有10.6%和10.2%的大腸直腸癌患者。他們進一步根據EMAST和MSI狀態進行分組,而最終將患者分為4組。
   EMAST陽性和MSI-H組的女性有較高的近端結腸腫瘤、早期腫瘤、低分化腫瘤患病率。此外,也較容易發生PI3KCA,BRAF,TGFBR,PTEN和AKT1的基因突變。他們也發現在EMAST陽性和MSI-H組的腫瘤組織中,MLH1,MSH3,MSH6,PMS2和EXO1突變頻率較高。

    最後,具有EMAST陽性和MSI-H的腫瘤是CRC的良好預後指標。研究發現EMAST陽性和MSI-H中幾個DNA修復基因的高突變率,顯示這種大腸直腸癌亞型可能更適合使用免疫療法。 
 

五、具有組織功能的血栓性血管瘤:皮膚血管瘤中GNA突變型的頻率研究

    在這項研究中,他們旨在介紹臨床病理和分子檢測中,具有GNA基因突變的獨特血管瘤特徵----血栓豐富的血管內,容易有血栓形成且組織有顯著的變化,他們將其稱為“血栓性具有組織/網狀特徵的血管瘤”( hrombotic
hemangioma with organizing/anastomosing features
),研究中發現了26例這種新型血管瘤的案例。
    這類血管瘤並沒有特別好發於男性或女性,患者年齡從17至89歲都有。除了1例發生在皮膚中以外,其餘所有案例都發生在頸部軟組織。值得注意的是,大多數發生在下腹部/腹股溝區域。組織學上,具有組織/網狀特徵的血管瘤中,其血栓形成的腫瘤是由大小不等、充血的薄壁血管組成。而最顯著的特徵是血栓形成和斑性組織血管內,內皮細胞會明顯的增殖。增生的內皮細胞展現出流式圖像,具有局灶性網狀特徵,和交織狀血管瘤( anastomosing hemangioma )十分相似。其細胞基質可以是硬化性的或是透明變性的,但可以是黏液狀/水腫的。
    從基因分析數據中,利用Sanger測序和MassARRAY分析,發現了GNAQ,GNA11和GNA14外顯子5突變,且有85%的突變率。這篇文獻描述了一個獨特的血管瘤,並發現其具有GNA突變型血管瘤的臨床病理特徵。
----------------------------------------------------------------------------

    這個系列的第二篇文獻介紹了櫻桃血管瘤,它是成人中最常見的血管瘤。目前根據其發病機轉在科學界已提出腫瘤和非腫瘤的理論,但其真實發病機制仍知之甚少。
    這篇研究發現交織狀血管瘤和先天性血管瘤的亞型具有一小群毛細血管,周圍有血管透明層,並聯想到櫻桃血管瘤中的血管樣貌。因此,在這項研究中,他們分析了68例櫻桃血管瘤和17例 類櫻桃血管瘤,並分析其非典型的特徵,包括明顯擴張的海綿狀血管,和/或延伸至真皮深層的深層組件。在櫻桃性血管瘤的Sanger定序的資料中,有12例鑑定出GNAQ突變,4例鑑定出有GNA11突變,32例具有GNA14外顯子5突變。在類櫻桃血管瘤組織,則分別鑑定出5例GNAQ突變、3例GNA11突變,及3例GNA14突變。
    進一步利用MassARRAY分析,則額外檢出了8例櫻桃血管瘤具有突變(包括外顯子2 GNAQG48V突變)、3例類櫻桃血管瘤具有突變。總體而言,櫻桃性血管瘤和類櫻桃血管瘤具有相似的GNA基因突變率(82%)。所有突變都是互斥的。這篇研究發現多數血管瘤患者中具有GNA14 / GNAQ / GNA11突變,並確立了其腫瘤性質,且發現GNA14為血管腫瘤中最常見的突變基因。

-----------------------------------------------------------------------------

    GNA研究系列第三篇介紹了交織狀血管瘤(AH),它是一種獨特的良性血管瘤,在組織學上可能容易與血管肉瘤相混淆。 在這項研究中,他們調查了26例AH的臨床病理和分子特徵。 透過Sanger定序和MassARRAY分析,鑑定出GNAQ外顯子5、GNA11和GNA14基因的互斥突變,分別檢出了10例、5例和5例腫瘤具有突變,總突變率為91%。不同突變間並沒有觀察到臨床病理特徵的差異。這篇研究發見GNA11、GNA14及GNAQ突變可能為交織狀血管瘤發病的重要驅動機制。

 

歡迎收看電子書內容:

http://online.flipbuilder.com/efae/jcww/

 

有需要pdf檔的相關研究人員,歡迎點選下列連結到我們的粉絲專頁messenger, 並輸入email ,我們就會寄送文獻回顧的檔案囉!
粉絲專頁私訊 

 

作者: 林宇馨 / 豐技生技產品專員

    豐技生技 發表在 痞客邦 留言(0) 人氣()