豐技生技's Blog

今天來和各位分享一篇臨床醫學領域中，微生物分析的經典研究案例，內容是關於克隆氏症的”creeping fat”現象，研究團隊根據不同的炎症及腸道部位，進行了非常清楚的控制組、實驗組和對照組的樣本蒐集，並進行16S metagenomics菌相分析、Biolog微生物代謝功能性分析、動物模型的建構以及免疫學功能分析。最後綜合這些實驗結果，詳細的驗證了整個疾病的發炎及微生物功能相關的訊息傳遞機制。
Photo by JAFAR AHMED on Unsplash

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Review articles是研究生剛接觸一個嶄新的研究主題時，不可或缺的資料。Review articles中文翻譯是評論性文章 (或稱為文獻綜述)，內容是針對特定的主題，帶領讀者一同回顧這個主題的過去文獻，並加以評論，最後總結目前的研究進展。對於剛踏入這個研究主題的新鮮人來說，可說是一篇研究回顧的懶人包，可以快速帶領研究員進入狀況，並找到未來的研究方向!
Photo by Markus Winkler on Unsplash

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非法採伐不但會嚴重影響生物多樣性，也讓森林保護難以維繫。非法盜伐也是全球令人頭痛的非法貿易，不但具有高額利潤，而且也很難被發現，進而起訴。
Photo by Gyanendra Sharma on Unsplash

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先前的文章曾經介紹過，粒線體是人體的能量工廠，參與了許多代謝反應 (延伸閱讀：●小知識分享● 千杯不醉就沒有酒精中毒的風險嗎?)，將我們食物攝取的營養轉化成人體可利用的能量。因此，如果粒線體功能異常，勢必會造成細胞死亡、影響正常的人體代謝功能。
(圖片來源: https://thescientificreporters.com/mitochondria-stress-in-the-powerhouse-of-the-cell/ )

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先前我們分享過不同的甲基化分析方式如果應用不當，都有可能導致實驗卡關，而讓研究無法繼續進行的案例。(歡迎複習一下: ” 怎麼做都無法得到甲基化PCR產物嗎? 換個方法試試吧!”  如果想知道更多甲基化分析的實驗方法，則歡迎閱讀” 如何進軍表觀遺傳學研究? 甲基化實驗方法總整理!”這篇文章)

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在” 如何進軍表觀遺傳學研究? 甲基化實驗方法總整理!” 這篇文章中，我們介紹了有哪些方法可以分析DNA甲基化。然而，在分析的過程中，很容易在PCR階段就卡關，而無法得到bisulfite target sequence (亞硫酸鹽反應後的標的序列)放大產物，到底是為什麼呢?

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每個人的個體差異，除了受到遺傳基因序列的影響以外，還有可能因DNA序列受到甲基化的化學修飾，而影響到後續表現出來的功能與性狀，這就是表觀基因體學(epigenomics)的一環。DNA甲基化如果發生在基因的啟動子(promoter)序列，則這個基因的表現就會受到抑制。

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GWAS大數據分析過後，要如何證實全基因組與疾病關聯性的掃描結果呢?

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在"如何從GWAS數據進展到臨床應用? 分析流程大解密!" 這篇文章中，我們已經了解到如何從大數據中撈出有用的基因資訊。 但在篩選的過程中，我們需要留意哪些細節呢?

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生物資訊的大數據分析發展至今，許多疾病的全基因組關聯分析(genome-wide association study, GWAS)也進入到了post-GWAS時代。相關資料庫、分析套件以及統計方法也越來越精緻，有許多生資人員開發了人性化操作介面與分析軟體，可以讓一般研究員後續在處理數據時，能更得心應手。

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