目前分類:研究員分析小撇步 (10)

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今天來和各位分享一篇臨床醫學領域中,微生物分析的經典研究案例,內容是關於克隆氏症的”creeping fat”現象,研究團隊根據不同的炎症及腸道部位,進行了非常清楚的控制組、實驗組和對照組的樣本蒐集,並進行16S metagenomics菌相分析、Biolog微生物代謝功能性分析、動物模型的建構以及免疫學功能分析。最後綜合這些實驗結果,詳細的驗證了整個疾病的發炎及微生物功能相關的訊息傳遞機制。

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Review articles是研究生剛接觸一個嶄新的研究主題時,不可或缺的資料。Review articles中文翻譯是評論性文章 (或稱為文獻綜述),內容是針對特定的主題,帶領讀者一同回顧這個主題的過去文獻,並加以評論,最後總結目前的研究進展。對於剛踏入這個研究主題的新鮮人來說,可說是一篇研究回顧的懶人包,可以快速帶領研究員進入狀況,並找到未來的研究方向!

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非法採伐不但會嚴重影響生物多樣性,也讓森林保護難以維繫。非法盜伐也是全球令人頭痛的非法貿易,不但具有高額利潤,而且也很難被發現,進而起訴。

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先前的文章曾經介紹過,粒線體是人體的能量工廠,參與了許多代謝反應 (延伸閱讀:小知識分享 千杯不醉就沒有酒精中毒的風險嗎?),將我們食物攝取的營養轉化成人體可利用的能量。因此,如果粒線體功能異常,勢必會造成細胞死亡、影響正常的人體代謝功能。

Mitochondria -Stress in the powerhouse of the cell - The ...

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先前我們分享過不同的甲基化分析方式如果應用不當,都有可能導致實驗卡關,而讓研究無法繼續進行的案例。(歡迎複習一下: ” 怎麼做都無法得到甲基化PCR產物嗎? 換個方法試試吧!”  如果想知道更多甲基化分析的實驗方法,則歡迎閱讀 如何進軍表觀遺傳學研究? 甲基化實驗方法總整理!這篇文章)

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如何進軍表觀遺傳學研究? 甲基化實驗方法總整理! 這篇文章中,我們介紹了有哪些方法可以分析DNA甲基化。然而,在分析的過程中,很容易在PCR階段就卡關,而無法得到bisulfite target sequence (亞硫酸鹽反應後的標的序列)放大產物,到底是為什麼呢?

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每個人的個體差異,除了受到遺傳基因序列的影響以外,還有可能因DNA序列受到甲基化的化學修飾,而影響到後續表現出來的功能與性狀,這就是表觀基因體學(epigenomics)的一環DNA甲基化如果發生在基因的啟動子(promoter)序列,則這個基因的表現就會受到抑制。

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GWAS大數據分析過後,要如何證實全基因組與疾病關聯性的掃描結果呢?

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在"如何從GWAS數據進展到臨床應用? 分析流程大解密!" 這篇文章中,我們已經了解到如何從大數據中撈出有用的基因資訊。 但在篩選的過程中,我們需要留意哪些細節呢?

「gwas study」的圖片搜尋結果

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生物資訊的大數據分析發展至今,許多疾病的全基因組關聯分析(genome-wide association study, GWAS)也進入到了post-GWAS時代。相關資料庫、分析套件以及統計方法也越來越精緻,有許多生資人員開發了人性化操作介面與分析軟體,可以讓一般研究員後續在處理數據時,能更得心應手。

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