PG-Seq 輕鬆自行建置NGS胚胎著床前基因檢測－豐技生技's Blog

在上一篇文章我們已經了解了PGT-A、PGT-M以及NI-PGT的差異，這篇文章讓我們為您以科學的角度，去探討PGT檢測的重要性，以及PerkinElmer PG-Seq的檢測技術。

PGT-A對於高齡產婦的重要性

若染色體發生非整倍體異常，則可能有96%的機率會發生胚胎著床失敗。而且染色體異常的胚胎在外觀上與正常胚胎並沒有太大差異。研究顯示，孕婦的年紀越大，則卵子發生非整倍體異常的機率就越高。在下方圖表中可以看到，胚胎染色體數量異常的發生率從30-34歲時的30％左右，增加到41-42歲時的近80％(桃紅色的長條圖)！同一張圖表中也可以發現，胚胎的植入率(紫色長條圖)以及流產率(藍色長條圖)都沒有顯著的差異，顯示第三代試管嬰兒(PGT-A)技術對於高齡產婦而言，是很棒的技術及福音。

PerkinElmer 開發一系列PGT檢測試劑，並不斷的簡化、優化PGT的檢測流程，目前最新的PG-Seq™Rapid 試劑套組使用兩個PCR步驟進行全基因組擴增，並且只需三小時的樣本建庫製備流程即可進行NGS上機分析。且適用Illumina^®或ThermoFisher^®IonTorrent^®各種定序機型。試劑套組包含了WGA放大試劑、建庫試劑以及自動化分析軟體PG-Find™，讓操作流程更簡單流暢。

PerkinElmer PG-Seq系列檢測試劑包括:

PG-Seq™ Rapid Non-Invasive PGT Kit
非侵入式的PGT檢測試劑，針對胚胎培養液及囊胚腔液( blastocoelic fluid )樣本進行試驗，進行皮克( pictogram, pg) 級的極微量DNA檢測。這組試劑已利用全球15個不同實驗室的非侵入性胚胎樣本進行優化，每個樣本都使用不同的胚胎培養方式，且測試結果和市面上其他PGT-A的commercial kit平測有高度的一致性。

PG-Seq™ Rapid Kit
具有高效率、極致簡化的操作流程，能精確檢測染色體數目異常，以及染色體結構重組(如：不平衡性轉位、片段異常)。檢測的解析度和PG-Seq^TM Kit 2.0一樣，以Illumina MiSeq機型為例，單次上機48個樣本，解析度可以檢出7Mb的缺失(deletions)或重複突變(duplications)。

PG-Seq™ Kit 2.0
提供一個可以同時進行PGT-A以及PGT-M的NGS檢測技術，可以精準檢測SNV (single nucleotide variants)。利用DOPlify® 全基因組放大(WGA)技術及標靶序列增幅試劑，即使檢測低濃度的PGT-M，也可以得到足夠的定序深度(>200x)。具有PG-Find™ 軟體，可以自動化分析最小5MB的染色體異常。

上述三種試劑均可在同一批次實驗中一同上機分析，其中PG-Seq™ Rapid Non-Invasive PGT Kit 以及 PG-Seq™ Rapid Kit 使用同樣的index編號及barcode，因此只要確認樣本index及barcode序列有錯開，就可以一同分析。PG-Seq™ Kit 2.0 使用不同的index系統，因此若有相關需求，可向technical support 索取修正後的sample sheet，即可一同上機分析囉!