目前分類:基因檢測技術 (6)

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在先前的抵禦外敵的無名英雄-淺談T細胞的發育過程 以及 疫苗注射後如何產生抗體? -淺談B細胞的免疫反應 這兩篇文章中,我們已經了解到,免疫系統之所以可以抵禦外敵,和T細胞以及B細胞的發育過程中所產生的受體多樣性有關。因此,我們可以利用這個特性,來檢測治療前及治療後的免疫細胞庫變化,以便瞭解治療後,是否能產生抵禦病源的免疫細胞,並分析這些免疫細胞的多樣性及增長狀況!

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粒線體是真核細胞中提供能量,產生ATP的主要胞器。關於粒線體的起源,內共生假說認為原粒線體被另一個細胞吞噬後,反而形成一種共存的關係,這也可以解釋粒線體有自己類似細菌的環狀基因組。人類的粒線體DNA (mitochondrial DNA, mtDNA) 包含16569個鹼基對,其中有37個基因及tRNA,每個細胞有100~10000個粒線體,而每一個粒線體大約有2~10組的mtDNA,因此,使用次世代定序技術 (NGS) 除了可以檢測SNPs與其他序列變異(SNVIndel),也可以對 Heteroplasmy 進行精確定量。一般來說,mtDNA為母系遺傳,因此也被當作一種分子標記,應用於演化、法醫、系統發育等研究。

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相信各位最近經常在電視媒體上看到檢測COVID-19的各種技術方法。到底什麼是RT-qPCR分生方法? 既然已經有免疫血清快篩了,為什麼還需要做分生檢測呢? 而加速檢測的效率到底帶來哪些好處與重大的影響?

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SABER is a MassARRAY-based Method for Detecting Rare Mutations.

2019年6月初我們曾在網誌中介紹“Agena MassARRAY基因型鑑定系統”是如何利用質譜儀技術,進行多叢PCR實驗來分析SNP型別,文中提到 MassARRAY 有一個”SABER”的實驗方法,可以檢測超微量突變分析。 到底SABER是什麼呢? 有任何相關研究及應用嗎? SABER 的全名是”single allele base extension reaction”,顧名思義,就是單一鹼基延伸反應。MassARRAY SABER 分析靈敏度可以檢測至1% 的DNA突變。

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DNA 甲基化是影響基因表現與否的重要調控機制, 主要是指在DNA 分子的胞嘧啶環(cytosine ring)的 5' 碳結構上,形成5-methylcytosine 的甲基化修飾。 我們是如何利用MassARRAY來進行DNA甲基化分析呢?
以下文章為您做更深入的分析原理介紹! EpiTYPER DNA 甲基化分析原理 包含四個反應步驟:Bisulfite conversion、PCR、MassCLEAVE (T7-IVT and Base-specific RNA cleavage)及Mass detection。

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從NGS、Array晶片拿到一組初步篩選後的基因位點資料,後續該如何做大規模樣本的驗證呢? 擔心研究計劃經費不足,或是計劃即將截止,害怕分析時間過長,來不及打完計劃結果嗎?


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