粒線體是真核細胞中提供能量,產生ATP的主要胞器。關於粒線體的起源,內共生假說認為原粒線體被另一個細胞吞噬後,反而形成一種共存的關係,這也可以解釋粒線體有自己類似細菌的環狀基因組。人類的粒線體DNA (mitochondrial DNA, mtDNA) 包含16569個鹼基對,其中有37個基因及tRNA,每個細胞有100~10000個粒線體,而每一個粒線體大約有2~10組的mtDNA,因此,使用次世代定序技術 (NGS) 除了可以檢測SNPs與其他序列變異(SNV與Indel),也可以對 Heteroplasmy 進行精確定量。一般來說,mtDNA為母系遺傳,因此也被當作一種分子標記,應用於演化、法醫、系統發育等研究。
當mtDNA產生變異、蛋白功能異常時,就會影響能量提供,對於各器官產生不同程度的病變。常見的例子包含Kearns-Sayre氏症候群 (KS)、雷伯氏遺傳性視神經病變、眼部肌肉癱瘓、運動障礙等。mtDNA的突變量通常要達到一定的量才會表現病癥,大約是高於70% mtDNA發生突變才會導致粒線體疾病。
適用領域
分子標記、演化、神經肌肉相關病變檢測
服務流程
分析需求討論 à 收件 à 樣本QC & 建庫 à 上機定序 à 數據分析 à 結果討論
服務週期 : 25個工作天
定序規格
Illumina MiniSeq/MiSeq/NextSeq,PE-150
建庫試劑 : QIASeq : DHS-105Z
定序深度 : 平均覆蓋率 >200X,可偵測 >5% heteroplasmy
樣品需求
DNA總量 |
>1 ug |
DNA濃度 |
>50 ng/uL |
DNA體積 |
>20 uL |
DNA純度 |
260/280 : 1.8~2.0、260/230 : >1.7 |
DNA無降解且無RNA汙染 |
分析內容
採 smCounter2 做 variant calling
提供序列QC、SNP/SNV、>5% heteroplasmy、58個已知致病位點
如果有相關研究需求,歡迎來電與我們聯繫,將有專人為您解說服務喔!
(02)2351-9800
作者: 楊閎宇 / 豐技生技NGS服務業務 編輯: 林宇馨 / 豐技生技產品專員
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